Частное образовательное учреждение на УСН, чьи доходы превысили лимит, с 2025 года обязано выполнять функции налогоплательщика НДС: вести журналы учета счетов-фактур, выставлять их контрагентам и подавать декларацию по НДС. Однако при оказании лицензированных образовательных услуг оно вправе применять льготу (освобождение от обложения НДС) на основании пп. 14 п. 2 ст. 149 НК РФ. Следовательно, по этим услугам НДС не исчисляется и не уплачивается, но факт применения льготы должен быть отражен в налоговой декларации.

Спорные выплаты носят социальный, а не стимулирующий характер, и не являются оплатой труда. Они были установлены коллективным договором компании, а не трудовыми договорами с работниками, и не зависели от квалификации, количества или качества работы. Поэтому они не должны включаться в базу для начисления страховых взносов по страхованию от несчастных случаев. Суды также отметили, что сам факт трудовых отношений не означает, что любая выплата работнику — это вознаграждение за труд, подлежащее обложению взносами.