С учетом положений абзаца второго пункта 6.2 статьи 210 НК РФ в отношении выплат, размер которых определяется исходя из средней заработной платы (среднего заработка), применяется налоговая ставка, предусмотренная пунктом 1.2 статьи 224 НК РФ, в части таких выплат, относящейся к суммам районных коэффициентов и процентных надбавок, указанных в пункте 6.2 статьи 210 НК РФ, применяемых непосредственно к суммам, которые учитываются для целей определения такой выплаты, при соблюдении условий, установленных данной нормой НК РФ.

Для целей автоУСН расходами признаются только затраты после их фактической оплаты (включая предоплату), но при этом они должны относиться к периоду применения этого режима. Расходы, относящиеся к периодам применения иных режимов налогообложения, при исчислении налоговой базы по автоУСН не учитываются.

Чиновники отметили, что источником формирования резервного фонда согласно пункту 1 статьи 35 Федерального закона «Об акционерных обществах» является чистая прибыль организации. Исходя из этого, Минфин пришел к выводу, что операции налогоплательщика по формированию данного фонда не оказывают влияния на налоговую базу по налогу на прибыль организаций.

Что касается научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ (далее - НИОКР), то в соответствии с подпунктом 16 пункта 3 статьи 149 Кодекса от налогообложения налогом на добавленную стоимость (далее - НДС) освобождается выполнение НИОКР за счет средств бюджетов бюджетной системы Российской Федерации, средств Российского фонда фундаментальных исследований, Российского фонда технологического развития и фондов поддержки научной, научно-технической, инновационной деятельности, созданных для этих целей в соответствии с Федеральным законом от 23 августа 1996 г. № 127-ФЗ «О науке и государственной научно-технической политике», а также выполнение НИОКР организациями, осуществляющими образовательную деятельность, и научными организациями на основе хозяйственных договоров.