Компания при выплате  сотруднику выходного пособия по увольнению в связи инвалидностью не включило эту сумму в базу для начисления страховых взносов. Пенсионный фонд РФ по итогам выездной проверки счел, что выходное пособие облагается взносами как выплата, произведенная в рамках трудовых отношений.

Компания построила объект, но не приняла его к учету в качестве основного средства, то есть не платила налог на имущество. Инспекция сочла, что объект отвечает всем признакам основного средства и подпадает под обложение налогом.

Организация в IV квартале получила оплату в сумме, превышающей стоимость товаров, и не начислила НДС с суммы превышения. В I квартале следующего года у нее была переплата по НДС. Инспекция по результатам выездной проверки, не охватывающей I квартал следующего года, квалифицировала указанную разницу как предоплату и  оштрафовала организацию.

Само по себе использование заемных средств и взаимозависимость продавца и покупателя не доказывает получение покупателем необоснованной налоговой выгоды от вычета НДС.

Организация заключила с банком договор на открытие кредитной линии с целью пополнения оборотных средств. Кредитным договором предусмотрена плата банку за неиспользованный лимит по кредиту. Организация уплатила банку указанную комиссию и учла ее в составе расходов при налогообложении. Инспекция сочла, что признавать такие расходы неправомерно.

Организация, применяющая ЕНВД, продавала контрагентам продовольственные и непродовольственные товары в магазинах - по розничным ценам, поштучно, для хозяйственных нужд. Договоры с контрагентами заключались в момент передачи товара, ассортимент и количество товара согласовывалось в накладной. Расчет производился в безналичной форме. Однако инспекция сочла, что организация работает по договорам поставки, а применять ЕНВД по такой деятельности неправомерно.

Организация, применяющая УСН, выставляла покупателю счета-фактуры с выделением в них НДС и получала оплату за товар в сумме с учетом НДС. Покупатель заявлял этот налог к вычету. Инспекция по результатам выездной проверки доначислила организации НДС, начислила пени и оштрафовала.

Организация выплатила на основании коллективного договора вознаграждения сотрудникам к праздничным датам - Дню защитника Отечества и Дню 8 Марта. Взносы на обязательное социальное страхование с этих выплат она не начисляла. Фонд социального страхования РФ счел, что эти выплаты облагаются страховыми взносами, так как произведены в рамках трудовых отношений.

Локальным нормативным актом Компании предусмотрены фиксированные компенсации сотрудникам за разъездной характер работ - для возмещения расходов, связанных с выездом в другой город, в том числе на личном транспорте. Фонд социального страхования оштрафовал Компанию за неначисление с таких выплат страховых взносов «на травматизм».

Компания наняла подрядчиков для проектирования и реконструкции здания. Выполнение указанных работ освобождено от налогообложения НДС в соответствии с пунктом 2 статьи 149 Налогового кодекса РФ. Однако, получив от подрядчиков счета-фактуры, Компания приняла «входной» НДС к вычету, так как считала, что предъявление ей счетов-фактур по операциям, с которых НДС исчислен к уплате, дает право на вычет налога.