Участники СПИК вправе претендовать на льготные ставки при зачислении налога как в федеральный бюджет, так и в бюджеты субъектов РФ. Однако главным условием остается ведение раздельного учета доходов и расходов по проекту, реализуемому в рамках инвестконтракта, и по иной деятельности. Наличие филиалов, по мнению чиновников, не меняет общий принцип формирования налоговой базы. Налог рассчитывается в целом по организации, а не отдельно по каждому подразделению. При расчете доли прибыли, приходящейся на обособленные подразделения (для уплаты налога в региональные бюджеты), учитываются показатели среднесписочной численности сотрудников (или расходов на оплату труда) и остаточной стоимости амортизируемого имущества именно этих подразделений.

Специалисты Минстроя  сделали однозначный вывод: для ТСЖ, осуществляющих управление многоквартирным домом, содержание и ремонт общего имущества за счет целевых взносов и платы за жилое помещение, нужно применять код ОКВЭД 68.32.1 — «Управление эксплуатацией жилого фонда за вознаграждение или на договорной основе» (входит в группу 68.32 «Операции с недвижимым имуществом»). В ведомстве также особо отметили, что деятельность товариществ не подпадает под код 68.32, если он определяется для служб коммунальной поддержки.

Доходы от предоставления банкам прав использования собственных программ для ЭВМ (включая лицензионные договоры и удаленный доступ) могут учитываться. Ранее действовавшее исключение, касающееся банковских и финансовых услуг, на передачу прав использования ПО не распространяется — если такая передача сама по себе не является оказанием финансовых услуг (дилерство, брокеридж, факторинг и т.п.).

Налоговая обязанность перейдет к ссудополучателю только в том случае, если водное судно было перерегистрировано на его имя в установленном порядке. Основанием для такой перерегистрации может быть, например, договор лизинга с последующим выкупом. Таким образом, для определения плательщика транспортного налога налоговые органы будут руководствоваться исключительно данными государственной регистрации судна, а не условиями договора между сторонами.

Налоговый кодекс  гарантирует ряд льгот на федеральном уровне. В частности, дети-инвалиды полностью освобождаются от уплаты налога на имущество физических лиц. Кроме того, для них предусмотрено уменьшение налоговой базы по земельному налогу: из общей площади участка вычитается кадастровая стоимость 600 квадратных метров. Что касается транспортного налога, то льгота распространяется непосредственно на семьи. Автомобили, полученные или приобретенные через органы соцзащиты в установленном порядке, не признаются объектом налогообложения.