Арбитры признали, что организация создала с контрагентом фиктивный документооборот.
Однако при этом работы выполнялись с привлечением реальных исполнителей. Поэтому фирме разрешили принять часть расходов.

Расходы организации или ИП, применяющего УСН и выбравшего в качестве объекта налогообложения доходы, не учитываются при определении налоговой базы.
Порядок признания расходов, принимаемых для целей налогообложения прибыли организаций, при методе начисления установлен в статье 272 Кодекса.
Расходы, которые не могут быть непосредственно отнесены на затраты по конкретному виду деятельности, распределяются пропорционально доле соответствующего дохода в суммарном объеме всех доходов.

Порядок признания расходов не зависит от того, были организацией получены доходы или нет.
Следовательно, ей нужно учитывать расходы для целей налогообложения прибыли организаций в установленном порядке.
Эти правила актуальны как в периоде получения доходов, так и в периоде, в котором организация доходы не получает, при условии, что осуществляемая деятельность в целом направлена на получение доходов.

Сумму излишне уплаченного налога можно засчитать в счет предстоящих платежей либо вернуть. Процедура возврата регламентирована нормами пункта 6 статьи 78 Налогового кодекса.
Нужно подать заявление в письменной форме либо в электронном виде с усиленной квалифицированной электронной подписью. Электронный документ передается по ТКС или через личный кабинет налогоплательщика.

Если авиабилет приобретен в бездокументарной форме (в электронном виде), оправдательным документом может быть сформированная автоматизированной информационной системой оформления воздушных перевозок маршрут/квитанция, в которой указана стоимость перелета.
Однако Налоговый кодекс не устанавливает конкретный перечень документов, которые подтверждают произведенные расходы. Поэтому организация вправе расходы на авиабилет любыми документами, напрямую или косвенно подтверждающими факт перевозки работника.